Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ACSL3O95573 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACSL3O95573 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSL3O95573 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSL3O95573 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms