Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF12O95522 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF12O95522 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms