Protein–RNA interactions for Protein: O95394

PGM3, Phosphoacetylglucosamine mutase, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM3O95394 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGM3O95394 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGM3O95394 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGM3O95394 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGM3O95394 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGM3O95394 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGM3O95394 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGM3O95394 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGM3O95394 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGM3O95394 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGM3O95394 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PGM3O95394 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGM3O95394 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGM3O95394 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGM3O95394 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGM3O95394 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGM3O95394 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGM3O95394 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGM3O95394 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGM3O95394 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGM3O95394 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGM3O95394 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGM3O95394 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGM3O95394 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGM3O95394 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGM3O95394 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGM3O95394 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGM3O95394 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGM3O95394 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGM3O95394 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGM3O95394 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGM3O95394 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGM3O95394 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGM3O95394 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGM3O95394 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGM3O95394 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGM3O95394 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGM3O95394 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGM3O95394 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGM3O95394 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PGM3O95394 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PGM3O95394 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGM3O95394 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGM3O95394 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGM3O95394 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGM3O95394 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGM3O95394 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGM3O95394 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGM3O95394 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGM3O95394 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PGM3O95394 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGM3O95394 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGM3O95394 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGM3O95394 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGM3O95394 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGM3O95394 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGM3O95394 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGM3O95394 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGM3O95394 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGM3O95394 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGM3O95394 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGM3O95394 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGM3O95394 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGM3O95394 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGM3O95394 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGM3O95394 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGM3O95394 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGM3O95394 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGM3O95394 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGM3O95394 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGM3O95394 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGM3O95394 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGM3O95394 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGM3O95394 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGM3O95394 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PGM3O95394 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGM3O95394 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGM3O95394 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGM3O95394 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGM3O95394 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PGM3O95394 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGM3O95394 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGM3O95394 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGM3O95394 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGM3O95394 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGM3O95394 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGM3O95394 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGM3O95394 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGM3O95394 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGM3O95394 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGM3O95394 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGM3O95394 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGM3O95394 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGM3O95394 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGM3O95394 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGM3O95394 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGM3O95394 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGM3O95394 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGM3O95394 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PGM3O95394 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms