Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MBD4O95243 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MBD4O95243 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MBD4O95243 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MBD4O95243 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MBD4O95243 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MBD4O95243 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MBD4O95243 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MBD4O95243 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
MBD4O95243 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MBD4O95243 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MBD4O95243 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MBD4O95243 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MBD4O95243 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MBD4O95243 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
MBD4O95243 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MBD4O95243 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MBD4O95243 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MBD4O95243 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MBD4O95243 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MBD4O95243 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MBD4O95243 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
MBD4O95243 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MBD4O95243 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MBD4O95243 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
MBD4O95243 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MBD4O95243 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MBD4O95243 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MBD4O95243 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MBD4O95243 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MBD4O95243 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MBD4O95243 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MBD4O95243 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MBD4O95243 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MBD4O95243 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MBD4O95243 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
MBD4O95243 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MBD4O95243 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MBD4O95243 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MBD4O95243 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MBD4O95243 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MBD4O95243 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MBD4O95243 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MBD4O95243 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MBD4O95243 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD4O95243 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD4O95243 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD4O95243 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD4O95243 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD4O95243 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD4O95243 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD4O95243 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD4O95243 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD4O95243 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD4O95243 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD4O95243 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MBD4O95243 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MBD4O95243 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MBD4O95243 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MBD4O95243 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MBD4O95243 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MBD4O95243 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD4O95243 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD4O95243 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD4O95243 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD4O95243 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD4O95243 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD4O95243 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD4O95243 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD4O95243 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD4O95243 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD4O95243 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD4O95243 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD4O95243 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD4O95243 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD4O95243 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MBD4O95243 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MBD4O95243 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MBD4O95243 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MBD4O95243 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MBD4O95243 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MBD4O95243 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
MBD4O95243 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MBD4O95243 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MBD4O95243 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MBD4O95243 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MBD4O95243 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MBD4O95243 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MBD4O95243 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MBD4O95243 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MBD4O95243 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MBD4O95243 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MBD4O95243 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MBD4O95243 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MBD4O95243 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MBD4O95243 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MBD4O95243 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MBD4O95243 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MBD4O95243 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MBD4O95243 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms