Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEC31AO94979 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC31AO94979 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC31AO94979 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC31AO94979 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC31AO94979 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC31AO94979 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC31AO94979 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC31AO94979 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms