Protein–RNA interactions for Protein: O75943

RAD17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD17O75943 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD17O75943 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD17O75943 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD17O75943 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD17O75943 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD17O75943 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD17O75943 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD17O75943 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD17O75943 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD17O75943 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD17O75943 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD17O75943 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD17O75943 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD17O75943 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD17O75943 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD17O75943 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD17O75943 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD17O75943 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD17O75943 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD17O75943 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD17O75943 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD17O75943 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD17O75943 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
RAD17O75943 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RAD17O75943 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RAD17O75943 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RAD17O75943 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RAD17O75943 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RAD17O75943 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RAD17O75943 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAD17O75943 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAD17O75943 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAD17O75943 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAD17O75943 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAD17O75943 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAD17O75943 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAD17O75943 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAD17O75943 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAD17O75943 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAD17O75943 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAD17O75943 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAD17O75943 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAD17O75943 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAD17O75943 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAD17O75943 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAD17O75943 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RAD17O75943 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RAD17O75943 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RAD17O75943 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RAD17O75943 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAD17O75943 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAD17O75943 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAD17O75943 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAD17O75943 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAD17O75943 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RAD17O75943 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAD17O75943 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAD17O75943 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAD17O75943 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAD17O75943 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAD17O75943 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RAD17O75943 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RAD17O75943 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAD17O75943 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAD17O75943 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAD17O75943 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAD17O75943 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RAD17O75943 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RAD17O75943 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RAD17O75943 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RAD17O75943 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RAD17O75943 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RAD17O75943 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RAD17O75943 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RAD17O75943 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RAD17O75943 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RAD17O75943 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RAD17O75943 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAD17O75943 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAD17O75943 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RAD17O75943 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAD17O75943 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAD17O75943 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAD17O75943 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAD17O75943 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RAD17O75943 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAD17O75943 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAD17O75943 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAD17O75943 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD17O75943 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD17O75943 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD17O75943 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD17O75943 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD17O75943 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD17O75943 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD17O75943 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD17O75943 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD17O75943 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD17O75943 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD17O75943 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms