Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB3O75712 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB3O75712 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB3O75712 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB3O75712 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB3O75712 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB3O75712 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB3O75712 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB3O75712 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB3O75712 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB3O75712 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB3O75712 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB3O75712 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB3O75712 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB3O75712 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB3O75712 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB3O75712 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB3O75712 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB3O75712 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB3O75712 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB3O75712 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB3O75712 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB3O75712 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB3O75712 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB3O75712 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB3O75712 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB3O75712 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB3O75712 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB3O75712 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJB3O75712 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB3O75712 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB3O75712 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB3O75712 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB3O75712 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB3O75712 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB3O75712 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB3O75712 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB3O75712 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB3O75712 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB3O75712 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB3O75712 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB3O75712 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB3O75712 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB3O75712 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB3O75712 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB3O75712 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB3O75712 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB3O75712 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB3O75712 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB3O75712 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB3O75712 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB3O75712 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB3O75712 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB3O75712 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB3O75712 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB3O75712 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB3O75712 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB3O75712 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB3O75712 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB3O75712 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB3O75712 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB3O75712 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB3O75712 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB3O75712 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB3O75712 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB3O75712 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB3O75712 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB3O75712 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB3O75712 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB3O75712 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB3O75712 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GJB3O75712 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJB3O75712 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GJB3O75712 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GJB3O75712 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB3O75712 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB3O75712 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB3O75712 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB3O75712 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB3O75712 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB3O75712 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB3O75712 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB3O75712 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB3O75712 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB3O75712 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB3O75712 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB3O75712 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB3O75712 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB3O75712 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB3O75712 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB3O75712 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB3O75712 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJB3O75712 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB3O75712 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB3O75712 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB3O75712 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB3O75712 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB3O75712 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB3O75712 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJB3O75712 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms