Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKAP2O75563 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKAP2O75563 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP2O75563 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms