Protein–RNA interactions for Protein: O75509

TNFRSF21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF21O75509 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF21O75509 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF21O75509 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF21O75509 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF21O75509 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF21O75509 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF21O75509 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF21O75509 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF21O75509 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF21O75509 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF21O75509 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF21O75509 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms