Protein–RNA interactions for Protein: O75494

SRSF10, Serine/arginine-rich splicing factor 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF10O75494 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRSF10O75494 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF10O75494 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF10O75494 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF10O75494 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRSF10O75494 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF10O75494 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF10O75494 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SRSF10O75494 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF10O75494 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF10O75494 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRSF10O75494 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF10O75494 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF10O75494 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRSF10O75494 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF10O75494 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF10O75494 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF10O75494 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF10O75494 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF10O75494 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF10O75494 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRSF10O75494 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF10O75494 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF10O75494 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF10O75494 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF10O75494 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRSF10O75494 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF10O75494 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF10O75494 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF10O75494 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRSF10O75494 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms