Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRCH4O75427 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRCH4O75427 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRCH4O75427 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRCH4O75427 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms