Protein–RNA interactions for Protein: O60565

GREM1, Gremlin-1, humanhuman

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREM1O60565 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GREM1O60565 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GREM1O60565 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GREM1O60565 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GREM1O60565 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GREM1O60565 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GREM1O60565 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GREM1O60565 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GREM1O60565 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GREM1O60565 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GREM1O60565 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GREM1O60565 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GREM1O60565 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GREM1O60565 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GREM1O60565 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GREM1O60565 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GREM1O60565 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GREM1O60565 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GREM1O60565 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GREM1O60565 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GREM1O60565 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GREM1O60565 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GREM1O60565 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GREM1O60565 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GREM1O60565 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GREM1O60565 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GREM1O60565 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GREM1O60565 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GREM1O60565 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GREM1O60565 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GREM1O60565 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GREM1O60565 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GREM1O60565 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GREM1O60565 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GREM1O60565 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GREM1O60565 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GREM1O60565 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GREM1O60565 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GREM1O60565 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GREM1O60565 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GREM1O60565 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GREM1O60565 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GREM1O60565 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GREM1O60565 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GREM1O60565 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GREM1O60565 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GREM1O60565 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GREM1O60565 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GREM1O60565 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GREM1O60565 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GREM1O60565 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GREM1O60565 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GREM1O60565 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GREM1O60565 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GREM1O60565 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GREM1O60565 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GREM1O60565 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GREM1O60565 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GREM1O60565 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GREM1O60565 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GREM1O60565 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GREM1O60565 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GREM1O60565 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GREM1O60565 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GREM1O60565 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GREM1O60565 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GREM1O60565 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GREM1O60565 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GREM1O60565 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GREM1O60565 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GREM1O60565 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GREM1O60565 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GREM1O60565 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GREM1O60565 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GREM1O60565 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GREM1O60565 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GREM1O60565 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GREM1O60565 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GREM1O60565 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GREM1O60565 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GREM1O60565 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GREM1O60565 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GREM1O60565 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GREM1O60565 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GREM1O60565 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GREM1O60565 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GREM1O60565 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GREM1O60565 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GREM1O60565 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GREM1O60565 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GREM1O60565 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GREM1O60565 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GREM1O60565 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GREM1O60565 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GREM1O60565 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GREM1O60565 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GREM1O60565 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GREM1O60565 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GREM1O60565 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GREM1O60565 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
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