Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GMDSO60547 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GMDSO60547 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMDSO60547 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMDSO60547 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMDSO60547 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMDSO60547 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GMDSO60547 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMDSO60547 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMDSO60547 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMDSO60547 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMDSO60547 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMDSO60547 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMDSO60547 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMDSO60547 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GMDSO60547 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMDSO60547 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMDSO60547 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMDSO60547 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMDSO60547 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMDSO60547 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMDSO60547 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMDSO60547 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMDSO60547 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GMDSO60547 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMDSO60547 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMDSO60547 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GMDSO60547 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMDSO60547 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMDSO60547 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMDSO60547 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GMDSO60547 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMDSO60547 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMDSO60547 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMDSO60547 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GMDSO60547 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMDSO60547 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMDSO60547 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMDSO60547 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GMDSO60547 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMDSO60547 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMDSO60547 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMDSO60547 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMDSO60547 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMDSO60547 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMDSO60547 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GMDSO60547 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GMDSO60547 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMDSO60547 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMDSO60547 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMDSO60547 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMDSO60547 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMDSO60547 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMDSO60547 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMDSO60547 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMDSO60547 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMDSO60547 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GMDSO60547 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMDSO60547 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMDSO60547 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMDSO60547 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GMDSO60547 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GMDSO60547 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GMDSO60547 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMDSO60547 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMDSO60547 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMDSO60547 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GMDSO60547 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMDSO60547 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMDSO60547 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GMDSO60547 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMDSO60547 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMDSO60547 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMDSO60547 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMDSO60547 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMDSO60547 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMDSO60547 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GMDSO60547 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMDSO60547 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMDSO60547 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMDSO60547 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMDSO60547 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMDSO60547 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMDSO60547 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMDSO60547 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMDSO60547 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMDSO60547 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GMDSO60547 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GMDSO60547 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GMDSO60547 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GMDSO60547 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GMDSO60547 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GMDSO60547 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GMDSO60547 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GMDSO60547 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMDSO60547 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GMDSO60547 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMDSO60547 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GMDSO60547 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GMDSO60547 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms