Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ATP10AO60312 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ATP10AO60312 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
ATP10AO60312 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
ATP10AO60312 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
ATP10AO60312 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
ATP10AO60312 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ATP10AO60312 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
ATP10AO60312 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATP10AO60312 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATP10AO60312 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATP10AO60312 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
ATP10AO60312 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
ATP10AO60312 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ATP10AO60312 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
ATP10AO60312 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ATP10AO60312 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ATP10AO60312 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ATP10AO60312 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ATP10AO60312 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ATP10AO60312 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ATP10AO60312 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ATP10AO60312 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
ATP10AO60312 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ATP10AO60312 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ATP10AO60312 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ATP10AO60312 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ATP10AO60312 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
ATP10AO60312 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ATP10AO60312 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ATP10AO60312 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ATP10AO60312 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ATP10AO60312 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ATP10AO60312 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ATP10AO60312 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ATP10AO60312 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATP10AO60312 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATP10AO60312 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATP10AO60312 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATP10AO60312 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ATP10AO60312 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ATP10AO60312 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ATP10AO60312 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ATP10AO60312 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ATP10AO60312 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
ATP10AO60312 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ATP10AO60312 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
ATP10AO60312 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms