Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF4O43474 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF4O43474 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF4O43474 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF4O43474 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF4O43474 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF4O43474 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF4O43474 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF4O43474 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF4O43474 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF4O43474 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF4O43474 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF4O43474 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF4O43474 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF4O43474 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF4O43474 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLF4O43474 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLF4O43474 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLF4O43474 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF4O43474 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF4O43474 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF4O43474 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF4O43474 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF4O43474 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF4O43474 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF4O43474 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF4O43474 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF4O43474 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF4O43474 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF4O43474 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF4O43474 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF4O43474 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF4O43474 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF4O43474 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF4O43474 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF4O43474 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF4O43474 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF4O43474 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF4O43474 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF4O43474 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF4O43474 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF4O43474 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF4O43474 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF4O43474 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF4O43474 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF4O43474 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF4O43474 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF4O43474 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF4O43474 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF4O43474 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF4O43474 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF4O43474 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF4O43474 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF4O43474 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF4O43474 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF4O43474 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF4O43474 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF4O43474 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF4O43474 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF4O43474 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF4O43474 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF4O43474 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF4O43474 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF4O43474 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF4O43474 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF4O43474 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF4O43474 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF4O43474 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF4O43474 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF4O43474 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF4O43474 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF4O43474 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF4O43474 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF4O43474 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF4O43474 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLF4O43474 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLF4O43474 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLF4O43474 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF4O43474 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF4O43474 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF4O43474 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF4O43474 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF4O43474 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF4O43474 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF4O43474 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF4O43474 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF4O43474 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF4O43474 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF4O43474 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF4O43474 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF4O43474 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF4O43474 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF4O43474 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF4O43474 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF4O43474 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF4O43474 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF4O43474 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF4O43474 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF4O43474 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF4O43474 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms