Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNAB3O43448 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNAB3O43448 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNAB3O43448 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms