Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMD3O43242 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMD3O43242 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD3O43242 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD3O43242 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms