Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SGSM2O43147 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SGSM2O43147 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SGSM2O43147 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SGSM2O43147 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SGSM2O43147 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SGSM2O43147 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SGSM2O43147 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SGSM2O43147 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SGSM2O43147 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SGSM2O43147 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SGSM2O43147 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SGSM2O43147 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SGSM2O43147 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SGSM2O43147 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SGSM2O43147 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SGSM2O43147 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SGSM2O43147 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SGSM2O43147 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms