Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNN4O15554 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNN4O15554 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNN4O15554 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms