Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEFVO15553 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEFVO15553 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEFVO15553 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEFVO15553 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEFVO15553 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEFVO15553 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEFVO15553 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEFVO15553 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEFVO15553 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEFVO15553 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MEFVO15553 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEFVO15553 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEFVO15553 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEFVO15553 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MEFVO15553 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEFVO15553 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEFVO15553 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEFVO15553 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEFVO15553 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEFVO15553 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEFVO15553 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEFVO15553 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEFVO15553 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MEFVO15553 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEFVO15553 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEFVO15553 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEFVO15553 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEFVO15553 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEFVO15553 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEFVO15553 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MEFVO15553 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEFVO15553 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEFVO15553 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MEFVO15553 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEFVO15553 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MEFVO15553 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEFVO15553 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MEFVO15553 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEFVO15553 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEFVO15553 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEFVO15553 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEFVO15553 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEFVO15553 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEFVO15553 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEFVO15553 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEFVO15553 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEFVO15553 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEFVO15553 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEFVO15553 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEFVO15553 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEFVO15553 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEFVO15553 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEFVO15553 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEFVO15553 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEFVO15553 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEFVO15553 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEFVO15553 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEFVO15553 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEFVO15553 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MEFVO15553 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MEFVO15553 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
MEFVO15553 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEFVO15553 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MEFVO15553 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEFVO15553 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEFVO15553 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MEFVO15553 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEFVO15553 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEFVO15553 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEFVO15553 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEFVO15553 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MEFVO15553 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEFVO15553 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEFVO15553 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEFVO15553 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEFVO15553 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEFVO15553 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEFVO15553 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEFVO15553 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEFVO15553 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEFVO15553 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEFVO15553 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEFVO15553 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEFVO15553 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEFVO15553 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEFVO15553 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEFVO15553 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEFVO15553 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEFVO15553 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEFVO15553 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEFVO15553 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MEFVO15553 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEFVO15553 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEFVO15553 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEFVO15553 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MEFVO15553 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MEFVO15553 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MEFVO15553 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEFVO15553 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms