Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
VGFO15240 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
VGFO15240 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
VGFO15240 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
VGFO15240 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
VGFO15240 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
VGFO15240 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
VGFO15240 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
VGFO15240 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
VGFO15240 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
VGFO15240 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
VGFO15240 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
VGFO15240 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
VGFO15240 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
VGFO15240 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
VGFO15240 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
VGFO15240 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
VGFO15240 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
VGFO15240 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
VGFO15240 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
VGFO15240 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
VGFO15240 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
VGFO15240 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
VGFO15240 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
VGFO15240 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
VGFO15240 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
VGFO15240 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
VGFO15240 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
VGFO15240 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
VGFO15240 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
VGFO15240 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
VGFO15240 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
VGFO15240 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
VGFO15240 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
VGFO15240 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
VGFO15240 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
VGFO15240 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
VGFO15240 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
VGFO15240 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
VGFO15240 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
VGFO15240 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
VGFO15240 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
VGFO15240 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
VGFO15240 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
VGFO15240 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
VGFO15240 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
VGFO15240 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
VGFO15240 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
VGFO15240 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
VGFO15240 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
VGFO15240 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
VGFO15240 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
VGFO15240 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
VGFO15240 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
VGFO15240 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
VGFO15240 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
VGFO15240 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
VGFO15240 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
VGFO15240 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
VGFO15240 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
VGFO15240 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
VGFO15240 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
VGFO15240 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
VGFO15240 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
VGFO15240 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
VGFO15240 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
VGFO15240 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
VGFO15240 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
VGFO15240 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
VGFO15240 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
VGFO15240 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
VGFO15240 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
VGFO15240 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
VGFO15240 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
VGFO15240 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
VGFO15240 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
VGFO15240 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
VGFO15240 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
VGFO15240 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
VGFO15240 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
VGFO15240 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
VGFO15240 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.22
VGFO15240 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
VGFO15240 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
VGFO15240 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
VGFO15240 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
VGFO15240 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
VGFO15240 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
VGFO15240 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
VGFO15240 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
VGFO15240 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
VGFO15240 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
VGFO15240 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
VGFO15240 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
VGFO15240 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
VGFO15240 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
VGFO15240 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
VGFO15240 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
VGFO15240 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
VGFO15240 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms