Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PITPNM1O00562 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PITPNM1O00562 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PITPNM1O00562 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PITPNM1O00562 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PITPNM1O00562 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms