Protein–RNA interactions for Protein: O00458

IFRD1, Interferon-related developmental regulator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1O00458 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFRD1O00458 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFRD1O00458 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFRD1O00458 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFRD1O00458 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFRD1O00458 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFRD1O00458 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFRD1O00458 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFRD1O00458 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFRD1O00458 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFRD1O00458 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFRD1O00458 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFRD1O00458 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFRD1O00458 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFRD1O00458 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFRD1O00458 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms