Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PIK3C2AO00443 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PIK3C2AO00443 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PIK3C2AO00443 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PIK3C2AO00443 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms