Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
CCER2I3L3R5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.93
CCER2I3L3R5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCER2I3L3R5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCER2I3L3R5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CCER2I3L3R5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCER2I3L3R5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCER2I3L3R5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCER2I3L3R5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCER2I3L3R5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCER2I3L3R5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CCER2I3L3R5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCER2I3L3R5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCER2I3L3R5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCER2I3L3R5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCER2I3L3R5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCER2I3L3R5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCER2I3L3R5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCER2I3L3R5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCER2I3L3R5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCER2I3L3R5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCER2I3L3R5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCER2I3L3R5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CCER2I3L3R5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CCER2I3L3R5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CCER2I3L3R5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CCER2I3L3R5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CCER2I3L3R5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CCER2I3L3R5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CCER2I3L3R5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CCER2I3L3R5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CCER2I3L3R5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms