Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMKR1H3BMG3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMKR1H3BMG3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMKR1H3BMG3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMKR1H3BMG3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMKR1H3BMG3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMKR1H3BMG3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMKR1H3BMG3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SMKR1H3BMG3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms