Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM227AF5H4B4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM227AF5H4B4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM227AF5H4B4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM227AF5H4B4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms