Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms