Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIGD1CA8MV81 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1CA8MV81 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HIGD1CA8MV81 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIGD1CA8MV81 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIGD1CA8MV81 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIGD1CA8MV81 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIGD1CA8MV81 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIGD1CA8MV81 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIGD1CA8MV81 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms