Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRM3A6NNA2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRM3A6NNA2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRRM3A6NNA2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRRM3A6NNA2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRRM3A6NNA2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms