Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM200CA6NKL6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM200CA6NKL6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM200CA6NKL6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms