Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC69A6NI79 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC69A6NI79 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC69A6NI79 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC69A6NI79 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC69A6NI79 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms