Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf118A6NHY6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C9orf118A6NHY6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C9orf118A6NHY6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms