Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NPIPB15A6NHN6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPIPB15A6NHN6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms