Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCAF2A6NFQ2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCAF2A6NFQ2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TCAF2A6NFQ2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms