Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC182A6NF36 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC182A6NF36 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC182A6NF36 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC182A6NF36 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC182A6NF36 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC182A6NF36 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC182A6NF36 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms