Protein–RNA interactions for Protein: A6NCS4

NKX2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-6A6NCS4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX2-6A6NCS4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX2-6A6NCS4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX2-6A6NCS4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX2-6A6NCS4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-6A6NCS4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-6A6NCS4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-6A6NCS4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-6A6NCS4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-6A6NCS4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX2-6A6NCS4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX2-6A6NCS4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX2-6A6NCS4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX2-6A6NCS4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX2-6A6NCS4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX2-6A6NCS4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX2-6A6NCS4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX2-6A6NCS4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX2-6A6NCS4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX2-6A6NCS4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms