Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POTEFA5A3E0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POTEFA5A3E0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POTEFA5A3E0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POTEFA5A3E0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POTEFA5A3E0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
POTEFA5A3E0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POTEFA5A3E0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POTEFA5A3E0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POTEFA5A3E0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POTEFA5A3E0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POTEFA5A3E0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POTEFA5A3E0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POTEFA5A3E0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POTEFA5A3E0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
POTEFA5A3E0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POTEFA5A3E0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POTEFA5A3E0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POTEFA5A3E0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POTEFA5A3E0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POTEFA5A3E0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POTEFA5A3E0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POTEFA5A3E0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
POTEFA5A3E0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POTEFA5A3E0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms