Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC162PA2VCL2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC162PA2VCL2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC162PA2VCL2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms