Protein–RNA interactions for Protein: A1A4G5

LNP1, Leukemia NUP98 fusion partner 1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNP1A1A4G5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LNP1A1A4G5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LNP1A1A4G5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LNP1A1A4G5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms