Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCRBV5S1A1TA0A578 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCRBV5S1A1TA0A578 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCRBV5S1A1TA0A578 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCRBV5S1A1TA0A578 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCRBV5S1A1TA0A578 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCRBV5S1A1TA0A578 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCRBV5S1A1TA0A578 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCRBV5S1A1TA0A578 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCRBV5S1A1TA0A578 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCRBV5S1A1TA0A578 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCRBV5S1A1TA0A578 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCRBV5S1A1TA0A578 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCRBV5S1A1TA0A578 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCRBV5S1A1TA0A578 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCRBV5S1A1TA0A578 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCRBV5S1A1TA0A578 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TCRBV5S1A1TA0A578 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCRBV5S1A1TA0A578 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCRBV5S1A1TA0A578 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCRBV5S1A1TA0A578 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCRBV5S1A1TA0A578 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCRBV5S1A1TA0A578 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCRBV5S1A1TA0A578 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCRBV5S1A1TA0A578 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCRBV5S1A1TA0A578 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCRBV5S1A1TA0A578 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCRBV5S1A1TA0A578 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCRBV5S1A1TA0A578 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TCRBV5S1A1TA0A578 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCRBV5S1A1TA0A578 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCRBV5S1A1TA0A578 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCRBV5S1A1TA0A578 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCRBV5S1A1TA0A578 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCRBV5S1A1TA0A578 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms