Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
A0A0U1RQJ8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A0U1RQJ8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A0U1RQJ8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms