Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms