Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms