Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EPHA6Q9UF33 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EPHA6Q9UF33 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms