Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms