Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms