Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM106BQ9NUM4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms