Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms