Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms